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高压蒸汽灭菌法
压力蒸汽灭菌处理方法的原理是医疗废物在高温、高压的工艺条件下运行20 min以上，压力蒸汽穿透物体内部，使微生物的蛋白质凝固变性而被杀死；需要注意的是使用此处理方法时必须对医疗垃圾进行破碎处理，破碎可以在蒸煮前也可以在蒸煮后，但国家环保局公布《医疗废物高温蒸汽集中处理工程技术规范》中规定破碎后的尺寸不得大于50mm。这种方法不适宜处理病理性垃圾，如人体组织和动物尸体等，对药物和化学垃圾的处理效率也不高。
热解法
热解是利用垃圾中有机物的不稳定性，在无氧或缺氧的条件下对之进行加热蒸馏，使有机物产生热裂解，经冷凝后形成各种气体、液体和固体，从中提取燃料油、油脂和燃气的过程。
化学消毒法
化学消毒法的实质就是将破碎后的医疗废物与一定浓度的消毒剂(次氯酸钠、guoyangyisuan、戊二醛、臭氧等)混合作用，并保证其与消毒药剂有足够的接触面积和时间，有机物在消毒过程中被分解、微生物被杀灭。消毒药剂与医疗废物大接触是保障处理效果的前提。通过使用剪切式式破碎设备提高破碎程度、保证消毒剂能够将其穿透。化学消毒法适合处理液体医疗废物和病理方面的垃圾，近也在逐步用于那些无法通过加热或润湿进行消毒灭菌的医疗废物处理。